MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 60315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	GAA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
2	NC_010718	AGA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
3	NC_010718	AGT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
4	NC_010718	TA	4	8	270	277	50 %	50 %	0 %	0 %	188584643
5	NC_010718	A	8	8	346	353	100 %	0 %	0 %	0 %	188584643
6	NC_010718	AAATT	2	10	372	381	60 %	40 %	0 %	0 %	188584643
7	NC_010718	TTA	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584643
8	NC_010718	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	188584643
9	NC_010718	GAA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
10	NC_010718	AATGAA	2	12	422	433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584643
11	NC_010718	TGC	2	6	550	555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584643
12	NC_010718	TGGCAG	2	12	561	572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188584643
13	NC_010718	TA	3	6	604	609	50 %	50 %	0 %	0 %	188584643
14	NC_010718	ATGC	2	8	641	648	25 %	25 %	25 %	25 %	188584643
15	NC_010718	TCA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
16	NC_010718	TAA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
17	NC_010718	AAG	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
18	NC_010718	TCC	2	6	907	912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584643
19	NC_010718	AGA	2	6	931	936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
20	NC_010718	GAAA	2	8	1017	1024	75 %	0 %	25 %	0 %	188584643
21	NC_010718	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
22	NC_010718	TCA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
23	NC_010718	TAA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
24	NC_010718	A	7	7	1151	1157	100 %	0 %	0 %	0 %	188584643
25	NC_010718	CAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584643
26	NC_010718	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
27	NC_010718	A	7	7	1214	1220	100 %	0 %	0 %	0 %	188584643
28	NC_010718	TGA	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
29	NC_010718	AAG	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
30	NC_010718	TGG	2	6	1387	1392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584643
31	NC_010718	TAC	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
32	NC_010718	ATGC	2	8	1412	1419	25 %	25 %	25 %	25 %	188584643
33	NC_010718	A	6	6	1445	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	188584643
34	NC_010718	GCAA	2	8	1821	1828	50 %	0 %	25 %	25 %	188584644
35	NC_010718	T	6	6	1876	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	188584644
36	NC_010718	ATA	2	6	1898	1903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
37	NC_010718	CT	4	8	1904	1911	0 %	50 %	0 %	50 %	188584644
38	NC_010718	ACT	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
39	NC_010718	GTT	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584644
40	NC_010718	CTA	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
41	NC_010718	T	6	6	1999	2004	0 %	100 %	0 %	0 %	188584644
42	NC_010718	ATA	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
43	NC_010718	A	6	6	2013	2018	100 %	0 %	0 %	0 %	188584644
44	NC_010718	ATT	2	6	2060	2065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584644
45	NC_010718	GAA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
46	NC_010718	GAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
47	NC_010718	A	7	7	2185	2191	100 %	0 %	0 %	0 %	188584644
48	NC_010718	TCA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
49	NC_010718	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
50	NC_010718	ATA	2	6	2273	2278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
51	NC_010718	TA	3	6	2362	2367	50 %	50 %	0 %	0 %	188584644
52	NC_010718	ATTA	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	188584644
53	NC_010718	TG	3	6	2456	2461	0 %	50 %	50 %	0 %	188584644
54	NC_010718	A	6	6	2532	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	188584644
55	NC_010718	TTAAA	2	10	2630	2639	60 %	40 %	0 %	0 %	188584644
56	NC_010718	AGA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
57	NC_010718	AGA	2	6	2697	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
58	NC_010718	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	188584644
59	NC_010718	AAG	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
60	NC_010718	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
61	NC_010718	TAGAAT	2	12	2795	2806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584644
62	NC_010718	ATC	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
63	NC_010718	AT	3	6	2944	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	188584645
64	NC_010718	TTG	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584645
65	NC_010718	TTG	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584645
66	NC_010718	T	6	6	3010	3015	0 %	100 %	0 %	0 %	188584645
67	NC_010718	AGA	3	9	3019	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584645
68	NC_010718	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	188584645
69	NC_010718	A	6	6	3064	3069	100 %	0 %	0 %	0 %	188584645
70	NC_010718	ATA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584645
71	NC_010718	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	188584646
72	NC_010718	ACTT	2	8	3279	3286	25 %	50 %	0 %	25 %	188584646
73	NC_010718	TA	3	6	3292	3297	50 %	50 %	0 %	0 %	188584646
74	NC_010718	AAAAAG	2	12	3330	3341	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584646
75	NC_010718	AAT	2	6	3418	3423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
76	NC_010718	AAAAAT	2	12	3443	3454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188584646
77	NC_010718	TAA	2	6	3463	3468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
78	NC_010718	ATA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
79	NC_010718	ATT	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584646
80	NC_010718	CCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584646
81	NC_010718	AGA	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584646
82	NC_010718	TTGC	2	8	3785	3792	0 %	50 %	25 %	25 %	188584646
83	NC_010718	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584646
84	NC_010718	GAT	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584646
85	NC_010718	ATAA	2	8	4007	4014	75 %	25 %	0 %	0 %	188584646
86	NC_010718	ACA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584646
87	NC_010718	TAC	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584646
88	NC_010718	GA	3	6	4101	4106	50 %	0 %	50 %	0 %	188584646
89	NC_010718	A	7	7	4165	4171	100 %	0 %	0 %	0 %	188584646
90	NC_010718	A	7	7	4331	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
91	NC_010718	TTA	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584647
92	NC_010718	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584647
93	NC_010718	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
94	NC_010718	TAG	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
95	NC_010718	GAAA	2	8	4510	4517	75 %	0 %	25 %	0 %	188584647
96	NC_010718	TTAA	2	8	4521	4528	50 %	50 %	0 %	0 %	188584647
97	NC_010718	A	6	6	4527	4532	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
98	NC_010718	AGT	2	6	4556	4561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
99	NC_010718	TAA	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
100	NC_010718	A	6	6	4678	4683	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
101	NC_010718	A	6	6	4755	4760	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
102	NC_010718	A	7	7	4763	4769	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
103	NC_010718	TAAC	2	8	4807	4814	50 %	25 %	0 %	25 %	188584647
104	NC_010718	AGA	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
105	NC_010718	GAAC	2	8	4847	4854	50 %	0 %	25 %	25 %	188584647
106	NC_010718	TAA	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
107	NC_010718	AAG	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
108	NC_010718	AAG	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
109	NC_010718	A	7	7	5047	5053	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
110	NC_010718	GAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
111	NC_010718	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
112	NC_010718	TAA	2	6	5183	5188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
113	NC_010718	A	6	6	5187	5192	100 %	0 %	0 %	0 %	188584647
114	NC_010718	TGTT	2	8	5219	5226	0 %	75 %	25 %	0 %	188584648
115	NC_010718	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584648
116	NC_010718	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	188584648
117	NC_010718	AGA	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
118	NC_010718	T	6	6	5313	5318	0 %	100 %	0 %	0 %	188584648
119	NC_010718	GAA	3	9	5329	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
120	NC_010718	ATA	2	6	5351	5356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
121	NC_010718	GTTTT	2	10	5378	5387	0 %	80 %	20 %	0 %	188584648
122	NC_010718	ATTT	2	8	5401	5408	25 %	75 %	0 %	0 %	188584648
123	NC_010718	A	6	6	5433	5438	100 %	0 %	0 %	0 %	188584648
124	NC_010718	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584648
125	NC_010718	GAA	2	6	5488	5493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
126	NC_010718	ATA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
127	NC_010718	TAA	2	6	5515	5520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
128	NC_010718	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
129	NC_010718	ATG	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
130	NC_010718	TA	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	188584649
131	NC_010718	GAT	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
132	NC_010718	AATTA	2	10	5784	5793	60 %	40 %	0 %	0 %	188584649
133	NC_010718	A	6	6	5863	5868	100 %	0 %	0 %	0 %	188584649
134	NC_010718	TGG	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584649
135	NC_010718	CAA	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584649
136	NC_010718	TGA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
137	NC_010718	T	6	6	6186	6191	0 %	100 %	0 %	0 %	188584649
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265	NC_010718	GAA	2	6	18579	18584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584652
266	NC_010718	AAG	3	9	18604	18612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584652
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